새벽배송 제한 논의로 인해 해산물과 농산물을 판매하는 소상공인들이 큰 타격을 우려하고 있다. 생선·채소 등은 신선도가 생명이라 배송 지연 시 매출이 절반 이하로 줄 수 있다는 지적이다. 특히 도서산간·농어촌 지역 소상공인들의 온라인 판로가 막히면서 생존 위협을 받는다는 목소리가 크다. 물류연구기관은 새벽배송과 주 7일 배송이 중단되면 연간 18조 원대의 소상공인 손실이 발생할 수 있다고 분석했다.